Basic Fluorescence Microscopy System - Deep Brain
型號:YH-BFMS-L
基本熒光顯微鏡系統(tǒng)主要用于觀察自由活動的動物神經(jīng)回路、腦深部鈣成像研究,比如小鼠或大鼠,通過可穿戴的熒光顯微鏡成像套管長期植入大小鼠的頭骨,植入的成像插管采用自動定心閉鎖機制很容易的植入到大小鼠身上。其中嵌入式熒光顯微鏡采用electrically pigtailed 和光纖連接,在可見光譜中,腦組織散射成像限制約150μm,腦表面成像無需插入全玻璃的替續(xù)透鏡(relay lenses),在比較大的大腦深處,則必須使用中繼透鏡系統(tǒng),包含均勻或梯度折射率玻璃棒、透鏡和棱鏡,使圖像聚焦顯微鏡物鏡和有效降低光路然后通過大腦組織。
系統(tǒng)配置
1. LED連接 / Ce:YAG 光纖光源;
2. 嵌入式熒光顯微鏡;
3. 熒光顯微鏡驅(qū)動器L型;
4. 嵌入式成像插管L型;
5. 輔助的光纖&電子旋轉(zhuǎn)連接頭;
6. 熒光顯微鏡固定器;
7. 虛擬顯微鏡;
8. 焦圈調(diào)整套;
9. 顯微鏡控制器軟件;
10. 顯微鏡成像分析軟件;
到目前為止我們有S型和L型顯微鏡,兩種型號都有分色光束分離器、M3光纖連接器、CMOS傳感器等,每個CMOS序號存儲在其電纜,有特定的保護層,校正過濾器可辨認(rèn)我們的軟件包,S型有平行板依賴于模型中的物鏡成像插管創(chuàng)建CMOS圖像。
下面的視頻顯示了自由活動小鼠使用Doric熒光顯微鏡以10幀/秒(fps))的速率在神經(jīng)元表達的深部腦成像的鈣信號GCaMP6,經(jīng)由Adam Packer, Michael H?usser lab, UCL提供,左邊視頻顯示的是原始數(shù)據(jù),右邊是使用我們成像分析軟件處理后的數(shù)據(jù)。
圖中顯示了16個細胞的熒光強度表達GCaMP6在D2受體表達中型棘突神經(jīng)元的間接途徑,這個視頻是在自由活動小鼠身上的紋狀體(大約4毫米深)采集的,經(jīng)由 Dr. Akiyo Natsubori (experimenter), and Dr. Kenji Tanaka (PI) from the Department of Neuropsychiatry, School of Medicine, Keio University提供的。
產(chǎn)品規(guī)格
系統(tǒng)相關(guān)組件
嵌入式熒光顯微鏡 Snap-in Fluorescence Microscope Body
S型和L型熒光顯微鏡兩種型號都有分色光束分離器、M3光纖連接器、CMOS傳感器等,每個CMOS序號存儲在其電纜,有特定的保護層,校正過濾器可辨認(rèn)我們的軟件包,L型裝有 0.5 NA物鏡,S型有平行板依賴于模型中的物鏡成像插管創(chuàng)建CMOS圖像。當(dāng)用于深部腦成像,熒光顯微鏡主體使用植入式成像插管,從底部到頂部傳輸圖像,每個顯微鏡都帶有保護帽。
熒光顯微鏡驅(qū)動器 (Fluorescence Microscope Driver)
熒光顯微鏡驅(qū)動器允許計算機控制激發(fā)LED光源、圖像采集和通過高速以太網(wǎng)通信播放單個或多個視頻圖像,它可以觸發(fā)或同步外部的記錄裝置和觸發(fā)其他設(shè)備,這個熒光顯微鏡驅(qū)動器附帶有顯微鏡控制軟件。熒光顯微鏡控制器軟件提供接口控制顯微鏡驅(qū)動器,軟件確保圖像采集和輸出16位標(biāo)記圖像文件格式(.tiff),tiff格式可以容易地與其他所有標(biāo)準(zhǔn)成像軟件讀取,圖像保存是16位像素深度,真正的圖像像素深度是10位,所以像素灰度值包含0到1020之間的數(shù)。這個分析軟件的基本功能是為用戶提供便捷,通過嵌入式熒光顯微鏡采集圖像并獲取相關(guān)的數(shù)據(jù),軟件以.tiff格式加載圖片,然后進行基本的圖像處理功能和輸出工具以.CVS格式保存熒光數(shù)據(jù),這個軟件不能代替標(biāo)準(zhǔn)分析工具Matlab、ImageJ或Excel,旨在提供基本的但有用的顯微鏡圖像處理算法。
熒光顯微鏡控制器界面
1. 圖像顯示框(Image box):顯示來自顯微鏡的圖像,可繪制感興趣的區(qū)域;
2. 鏡頭設(shè)置(Camera Settings):設(shè)置曝光時間以毫秒為單位(21 - 1000之間)和探測器的增益(0和2之間);
3. 照明控制(Illumination Control):設(shè)置LED輸出功率(%),實際的光功率取決于驅(qū)動模式,LED成像是自動開啟/關(guān)閉;
4. 采集控制(Acquisition Controls)啟動和停止不同的操作模式;
Live: 獲取圖像并顯示它們,這些圖片僅用于顯示和不能保存。
Snapshot(抓拍): 保存圖像到用戶定義的文件。
Album(專輯):獲取圖像并添加到專輯棧,用戶可以將整個棧保存為分離文件,或作為一個圖像棧。
Record(記錄): 獲得連續(xù)的圖像流,并將它保存到用戶自定義文件作為一個圖像棧。
Time Serie(時間系列): 打開時間系列接口界面創(chuàng)建一個成像實驗,實驗由多個成像系列在多個時間點,時間間隔分開。摘要部分明確了實驗參數(shù)。
5.外觸發(fā)器(External Trigger):打開外部觸發(fā)接口,顯微鏡驅(qū)動器等待觸發(fā)器IN連接頭的信號,并創(chuàng)建一個專輯由用戶自定義指定的接口幀數(shù)。
6. ROI管理(Roi Manager):顯示live用戶繪制ROI像素強度,清除按鈕清除繪制的ROI和圖表。
7.對比度設(shè)置(Contrast Settings): 對比度設(shè)置主要改變顯示,用于對live預(yù)先篩分。
8. 以太網(wǎng)設(shè)置(Ethernet Settings):以太網(wǎng)設(shè)置配置IP地址,用于接收顯微鏡驅(qū)動器的數(shù)據(jù)。
成像圖像分析界面
1. 功能菜單(Function toolbar):功能菜單欄是被功能分開的。
輸入/輸出(I/O): 包含加載圖片和保存圖像功能。
ROI管理:包含了繪制、查找單元和清除所有功能,每個ROI手繪或自動查找功能都由ROI管理。
對比度調(diào)整(Adjust): 調(diào)整部分包含圖像對比度調(diào)整功能,這些功能在圖像框中臨時應(yīng)用,不保存圖像。
處理功能(Processing):處理部分包含子像素注冊的排列圖像功能,刪除背景照明功能,復(fù)位按鈕可以重新加載原始圖像棧。
路徑(Traces): 包含輸出功能,可以輸出ROI平均強度數(shù)據(jù) .CSV 文件。
2. 圖像框(Image box):在框里可以繪制對個ROIs,ROI是用藍色突出顯示, ROI索引在左上角。
3. ROI 管理(ROI manager):分兩部分,左邊是 ROI參數(shù),右邊是ROI列表。
ROI參數(shù): 包含ID、圖形框里ROI索引顯示 、ROI區(qū)域像素和坐標(biāo)。
ROI 情節(jié)列表:顯示ROI像素值的平均強度,那些軌跡可以通過工具欄里輸出按鈕輸出。
單通道LED連接組件(Connectorized Single LED)
組件描述:堅固緊湊的高亮LED模塊可接入不同類型的光纖,通過FC接線允許更改或替換的光纖跳線。我們?yōu)楣饫w方法提供了一個最大可能的耦合效率,非常適合LED與多模光纖的耦合,耦合效率取決于LED發(fā)射大小、光纖芯直徑和光纖的數(shù)值孔徑,工廠測試的光耦合是1毫米的塑料光纖和200μm直徑和0.53 NA玻璃光纖。
嵌入式成像插管 Snap-in Imaging Cannula
嵌入式成像插管和調(diào)焦圈
普通光纖套管可以發(fā)送光但不創(chuàng)建或獲取圖像,成像套管可以傳輸圖像,但是在高度混濁介質(zhì)比如腦組織,只有很短的距離,接近大腦表面附近的區(qū)域可以使用S型成像插套管,對于更深層次的大腦區(qū)域,則需要使用嵌入式L型成像套管通過影像引導(dǎo)梯度折射率棒透鏡來查看內(nèi)部腦組織,從而將腦成像從大腦內(nèi)部反應(yīng)到顱骨表面。這些熒光顯微鏡焦圈是非常重要的選擇,不同深度范圍的腦組織使用不同長度的調(diào)焦圈,而好的聚焦是從每個套管開始通過調(diào)整焦圈完成的,套管是可以被重復(fù)使用的。
調(diào)焦圈套件 Focus Adjustment Ring Set
做為觀察要點可以在大腦中任何地方,一套調(diào)焦圈用于不同的高度調(diào)節(jié),通過結(jié)合兩種梯度折射率棒透鏡和4個調(diào)焦圈可以覆蓋大部分的腦區(qū),外形尺寸上,調(diào)焦環(huán)的高度分別是2.05毫米,2.77毫米,3.48毫米和4.2毫米。
下表提供了調(diào)焦圈和成像插管結(jié)合可達到的穿透深度范圍。
Table :Depth range vs Focus adjustment ring set
虛擬顯微鏡Dummy Microscope
虛擬顯微鏡是外觀相似、廉價的嵌入式熒光顯微鏡復(fù)制品,可以安裝在任何嵌入式成像插管,主要用于實驗前期固定嚙齒動物頭部訓(xùn)練用的,從而最大限度減少在使用真正的熒光顯微鏡之前的損失,虛擬顯微鏡有一個M3連接頭,可以連接到CM3光纖。
輔助的光纖&電子旋轉(zhuǎn)連接頭
光纖&電子旋轉(zhuǎn)接頭(fiber-optic&electrical rotary joint)
在光遺傳學(xué)(optogenetics)實驗中通過結(jié)合光刺激和電生理記錄,可以觀察到相關(guān)的電脈沖光刺激。在這個階段,大多數(shù)的研究都集中在結(jié)合梳狀電極與單一的照明光纖或光纖電極。為了促進這種活體實驗,光纖&電子旋轉(zhuǎn)接頭比整合的電子旋轉(zhuǎn)接頭更緊湊,光纖通過電子轉(zhuǎn)接頭的中心孔穿過,與FC連接器兩端連接進行光通信,光滑有效,這個轉(zhuǎn)接頭主要適用于小鼠。